Экспозиция музея размещается в двух залах. Первый зал посвящен истории партизанского движения в Курской области в годы Великой Отечественной войны. В нем представлены фотографии и личные вещи командиров и бойцов партизанских отрядов. В экспозиции воссоздан фрагмент интерьера дома в пос. Михайловский, который являлся конспиративной квартирой и штабом Михайловского партизанского отряда. Об особенностях быта солдат рассказывает раздел «Землянка».
Особое место в экспозиции занимают материалы, посвященные трагедии населенных пунктов Михайловского района. За 17 месяцев оккупации немецко-фашистскими захватчиками были полностью или частично уничтожены 19 населенных пунктов. 624 жителя были замучены, расстреляны, заживо сожжены. В поселке Большой Дуб 17 октября 1942 г. были расстреляны 44 мирных жителя, из которых 26 были детьми, а пятеро – грудными младенцами. От поселка остался только фрагмент дерева, давшего ему название. Его можно увидеть на выставке.
Во втором зале музея представлены материалы, рассказывающие об освобождении Михайловского района от немецко-фашистских захватчиков и участии михайловцев и железногорцев в Великой Отечественной войне. В экспозиции помещены предметы вооружения и личные вещи солдат и офицеров, обнаруженные железногорским поисковым отрядом «Рубеж» во время работ на местах боевых действий.
Экспозиция дополнена мультимедийными средствами. На экранах демонстрируются фотографии и видеохроника, позволяющие погрузиться в грозную атмосферу военных лет.