Музей размещен в бывшей торговой лавке купца Я. Ф. Абакумова, построенной в XIX веке. В первой половине 1960 года надстроен второй этаж здания. В 1966 году открыт Обоянский музей, в дальнейшем ставший Обоянским краеведческим музеем – филиалом Курского областного краеведческого музея.
В экспозиции представлены материалы для самостоятельного осмотра о возникновении Обоянского острога, построенного для обороны южных границ государства от кочевников со стороны Дикого поля. В ХVIII–ХIХ веках купеческий город активно строился, были возведены храмы Святой Троицы, Александра Невского и старейшая церковь Смоленской иконы Божией Матери.
В четырех экспозиционных залах раскрыта многовековая история района и как крепости, защищавшей Московское княжество от набегов крымских татар, и как торгового центра на тракте Москва-Харьков. Здесь можно увидеть артефакты археологии и палеонтологии, найденные на территории Черноземья, материалы об обоянских купцах и знаменитых земляках. Посетители познакомятся с предметами быта крестьян и купцов Обоянского уезда, с экспонатами, относящимися к Отечественной войне 1812 года, Первой Мировой, Гражданской и Великой Отечественной.